X章进化的现在续

数码暴龙生存的数码世界，正面对了因迫近容量界限而崩溃的危机。数码世界的主计算机Yggdrasil，为了防范危机而要执行删除数码兽的程序。在程序删除众数码兽时，拥有强韧生命力的数码兽逃往了新数码世界。幸存下来的多路兽因此遇见了少年光太！视幸存的数码兽为异分子的“神”，为了清剿它们而派遣圣骑士奥米加兽。多路兽虽然实现究极的X进化成为多路战龙兽，但仍败给奥米加兽。就在这生死之间，它发动了可怕的死亡进化，惊异的破坏生命体就此诞生了！勇治和龙太兽在严浩旅途的尽头——东方之地，终于得到传说的王龙力量！暗多路战龙兽的“破坏冲击”在失去生命数据后仍然活动，暗亡兽因而在未来世界出现。面对能推开奥米加兽的奥义的压倒性力量，在已看不见未来曙光时，多路兽实现进化成为究极战士阿尔法兽，与王龙兽赶来了！属于自己的，赌上未来的最后决战！结局就刻印在你的Pendulum中。实现了究极的X进化的多路战龙兽实力压倒了皇家骑士！尽管面对这九死一生的危机，圣骑士奥米加兽也不会坐视不管！多路战龙兽进化成了暗多路战龙兽，被强行转送到数码世界以外的地方。多路兽成功被抽走，回到了原来地方，剩余数据则转送至位于「未来」的「NEW数码世界」。但是剩余的数据却进化了，成为了怪物一样的东西，「未来」的万物不断被它侵蚀，然后消失……最终战斗舞台在「未来」的「NEW数码世界」中激荡！为了回避数码世界危害的对策「プロジェクト：アーク（箱舟计划）」，「世界树Yggdrasil」只把必要的圣骑士和一部分的数码暴龙迁移到新数码世界，然后删掉其他的数码暴龙的「X－程序」。可是生命拥有的「生存本能」，使持续生命的“X-进化”和“死亡的X-进化”分开了……因为没有生命，而不能分类的程序临时出现的形态，没有实体。永远重复把数码核分解，全部都无法再构成，直至所有数码核被它分解。因为只是单纯的程序，所以要打倒它几乎是不可能的。「坚决排除这个X抗体！」圣骑士奥米加兽把矛头指向了位于「未来」的「新数码世界」出现的怪物，并展开攻击！发动了可称作预知能力的最终的力量「オメガインフォース」，不断使出必杀技「オールデリート」。不过在瞬间奥米加兽感觉到其攻击无法击败眼前的怪物。被认为「绝对不会出现」的圣骑士降临！！「X抗体」开始引导隐藏了拥有神圣力量的「X-进化」数码暴龙，与驯兽师一起的多路兽进化成圣骑士阿尔法兽。寻求新的进化的多路兽。寻求新的战斗力的龙骀兽。以前作为数码暴龙原型严酷的实验中残存的「试作类数码暴龙」在「新数码世界」的「现在」和「过去」的世界生存下去，并且，成为最终的形态超越时空，到达「未来」。