过渡数计算公式举例说明

已得的算术平方根乘以20再加上下一位试的算术平方根

如：

1、×20+7=27

17×20+3=343

173×20+2=3462

Gaussian03计算过渡态的大体原则如次：

1. 计算以前，绝对是要多查阅文献，看看是不是有类是的计算以及过渡态的构型构象等等，这对于猜测过渡态结构非常有用。文献以外答对于反应的类型、路子尽可能考虑全面，对于各种过多态的空间结构有较深的

2. 对于体系面生时，只管使用QST3方法去做，即要输入反应物、构想的过渡态、产物举行计算。而非直接用TS或QST2方法。

3. 鉴于计算的复杂性，初次计算提议使用HF方法，基组为3-21g即可，我的意思是起首接纳小基组小方法，这对于计算来讲颇有必要，不然计算工作量很大。

4. 计算出现纰缪是很正常的，处理的方法是：

A、修改结构（一般修改的幅度为反应部位±0.1-0.2A）

B、增长循环回数（此针对于Link9999），方法是OPT（Maxcycle=500）SCF(maxcycle=3000)

C、减小步长（IOP的1/8适当减低，这有利于震荡收敛的景象）

D、将计算结果（XYZ坐标从头输入作为计算初始值）

总之用HF方法必须找到过渡态，即一个负频，不然，底下的叙述将失去其价值。

5. 用HF计算出来的结果是欠佳的，因为HF方法未考虑到电子的相关效应，也是患上不到承认的（冯浩语），故而咱们该当用更为高级一些的方法去计算，好比DFT、CCSD(T)等等。但是颠末HF计算的磨难然后接着的问题会更加贫苦，原因是计算堕落用上面所说的方法做处理有时很难奏效，于是乎我想到了一下解决路子：

A．将HF方法计算的坐标从头做输入，并再次用QST3方法，施用的方法以及基组为：b3lyp/6-311 g(d,p) 直接举行计算，也能够用先用b3lyp/6-31g 计算，然后用b3lyp/6-311 g(d,p)接着计算，我可以肯定的说，后者中先优化的时间并非很长，虽则步骤是多些，但有时确实能够解决前者难以估计的过渡态。

B、除此以外，我想说几句，计算对于呆板的要求很高，平均而言，用QST 3计算过渡态很费时间，我计算17-21个原子，计算时间在1Day and 10 hours to 3 Days and 11hours .

C、如果方法A中仍不奏效，直接将HF计算结果放在TS中做计算，或许可行，原因是你的反应物以及产物编写的结构不是太好，其对于反应的引导意义也大大减低甚至有负作用。当然如果QST3计算时老是犯一样的错误，用原则4中的方法均已失灵，那末就直接用TS计算。

D、在此，本人多言几句，要经常查看计算的结果以及预期设想的是不是不同很大，不要闷着头就是弄计算，这也是所谓的，既要埋头拉车，又要抬头看路！

E、如果上面所说的方法再次连连无效，这人另有一招，此招颇为贫苦，见效环境目前看来还算可以：HF方法计算的过渡态通过IRC（反应路径分析），计算两个标的目的的反应环境，找出与反应位置极为相仿的地方的反应物，找出其对于应的坐标，然后找出与产物极其相是的结构，如此将找到反应物、过渡态、产物的HF方法下的结构，归入QST3计算，因为这些结构要比起初咱们自己绘制的好患上多！

当然上面所说的方法仅为本人经验，实战匮乏，如果上面所说的方法仿照还是不能奏效，则应考虑结谈判反应道理等的问题，毕竟，我用这些方法将自己要找的10个过渡态全数找出来啦。除此以外你可以将原因直接复制到Goolge中扣问一下方法（孟繁臣语），一般也会用一些可供参考的答案。当然本人也有一些类是的经验，你可以将问题放在“海角问答”中做咨询，一般不出几日即可有答案，答案是海角问答将答案发送到你的邮箱，也很方便。

6. 相信，你的努力一般会在一个星期会更长一段时间内才会有开真个进展，你要明白，计算一个体系，只要找不到，基本上一个找不到；只要找到一个，底下的基本水到渠成啦。所以你要耐受得住不断LinkDied的痛苦。上帝给你笑脸以前肯定会给你无如！我的这一段话仅想说明，过渡态计算与心态的问题，也相信诸位到时也有一样的觉患上！在此留给诸位一句话：No pain，no gain.

7.OK,终极要牵扯到用IRC计算来验证过渡态，来寻觅其它的过渡态，来分析反应的路径，来处理反应的Gibbs自由能以及反应的焓变，来以及反应的热能功学以及动力学联合起来。由于本人目前水平有限，此时仅做提笔，详细修改时间有待定夺，望此文有助于诸位早有所成！