转录组基础--什么是RNA-seq
发表时间：2024-08-09 20:14:07
来源：网友投稿
当进行转录组学数据分析时，会发现有两种数据。一种被称为芯片数据（Microarraydata)，另一种是下一代测序技术（NGS）得到的数据（eg，二代测序，三代测序）。
目录1.Microarray:芯片数据2.NGS(NextGenerationSequencing)3.RNA-Seq的应用
原理：基于分子杂交技术，主要是依靠印刷有荧光标记探针的基因芯片来实现。比如说基因组芯片，它高密度的集成了分辨率高达几bp~100bp的探针，通过与样品杂交荧光显色的办法来刻画转录组的信息。
直接对cDNA进行测序。下一代测序（NextGenerationSequencing，NGS）又名高通量测序（High-ThroughputSequencing），是相对于传统的桑格测序（SangerSequencing）而言的。
RNA-Seq即对转录组进行测序和分析。一般来说在研究所会委托公司测序得到数据自己进行后续的生信分析（质控，mapping，差异基因表达分析，SNV分析等）。RNA-Seq有着巨大的应用前景。
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