10Xgenomics技术特点
ChromiumTM Single Cell 3′ Solution是基于10 X Genomics平台,能够一次性分离、并标记500–10000个单细胞,并能在单细胞水平进行检测的技术,其通过微流控系统,将单细胞或长片段DNA分子快速分配到油包水的微反应体系中,每个微反应体系中的单DNA分子会获得唯一的特异性分子标签,制备生成的测序文库可以在illumina平台进行测序,并由10x Genomics提供数据分析及可视化软件,测序实验及分析流程可以和illumina系统无缝衔接。
该平台广泛应用于3’单细胞转录组测序、基因组组装应用、免疫组库测序、ATAC-seq、人全基因组及全外显子组测序。
10x Genomics单细胞转录组测序有效地解决了组织样本无法破解的细胞异质性难题,有助于发现新的细胞类型;并基于大量的单细胞基因表达数据,可以提供细胞表达特征聚类、亚群表达特征的分析、标志物筛选等方面的分析,是一种高效的单细胞基因表达水平检测技术。
10X GENOMICS单细胞转录组测序优缺点10x Genomics单细胞转录组测序优点1、简单便捷:集单细胞分选、扩增、建库于一体;
2、细胞通量高:每个样本细胞数可达500-10000个;
3、建库周期短:1天可完成细胞悬液制备、单细胞捕获、扩增及建库;
4、超高捕获效率:单细胞捕获效率高达65%;
5、真正意义的单细胞:单个液滴捕获到多个细胞的概率极低(0.9%/1000cells);
6、价格实惠:相较于其它单细胞平台,价格实惠。
10x Genomics单细胞转录组测序缺点1、非全长信息:只能获得3’端转录本信息;
2、样本要求高:单个样本细胞起始量达10^5-10^6个,活细胞数目需超过80%,建议在90%以上最佳。
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