《梅花档案2》是吴珊执导的32集国产剧电视连续剧，张明明等明星强势加盟参演出身农村却努力向上的郑天继是新昌医院年轻有为的外科医生，得到了全院的认同和赞赏。而同是外科医生的吴江川出身医学世家，是医院公认的天之骄子。经历截然不同的两个人，却都拥有着一份让人羡慕的感情，吴江川的妻子是著名的舞蹈家刘白，而郑天继的女朋友叶珊珊家世也十分显赫，可惜却患有严重的心脏病。农村姑娘白小梅由于心脏病，带着一幅神秘的梅花图住进了新昌医院，却意外的死在了手术台上。手术的失败给主治医生郑天继以沉重的打击，一次又一次的陷入了恐慌之中，甚至让他失去了拿起手术刀的勇气，而他自己也渐渐发生了变化。与此同时，由于在排练中受伤而移植了白小梅的眼角膜的刘白，在移植手术完成后便遭遇了一件又一件怪异的事件，最终患上了妄想症，行为也随之变得越来越奇怪。本来对医院副院长之位势在必得的吴江川，则在刘白的打击下萎靡不振。而对副院长之位毫不在乎的郑天继，是否真的甘愿屈居人下？还是心里有着另一番打算？最终，迷失了自我的刘白能否揭开手术背后的真相？死里逃生的吴江川又将面对怎样的人生？而以善良热心著称的郑天继为了守住内心的秘密该何去何从？面对爱人的种种变化，迷茫的叶珊珊又该如何选择？一次意外揭开一段神秘往事，一双移植而来的眼角膜引出一桩桩惊悚事件，一个错误的决定改变了四个人的命运。在这间小小的医院里，主人公们正一个个的被卷入到一场漩涡当中……