第1集剧情

Paul成为Echo的监护人后的首次任务。Echo这次的任务是担任一个新生婴儿的母亲，印记却导致了意想不到的副作用。Adelle督促Madeline回玩偶屋完成最后的检查。DanielPerrin参议员高调宣布调查玩偶屋的后台Rossum公司。

一个Rossum公司大股东的侄子因车祸陷入昏迷，遂命Adelle使用玩偶屋的技术令其苏醒，然而Topher在扫描其脑部的过程中发现对方竟是一个连环杀手，并且此时仍有数名受害者正被其关押！为了探得受害者的下落Victor被植入了这位连环杀手的印记，却逃离了玩偶屋。

当Topher欲远程擦除Victor的连环杀手印记时意外发生了，Victor与正在执行任务的Echo互换了印记。

本集交待了Sierra的过去。一个名叫NolanKinnard的男人为了得到Sierra费尽心机仍然不能如愿，遂施计将Sierra变成了玩偶。得知真相的Topher当得到将Sierra永远交给Nolan的命令后决定帮助Sierra。

Madeline作为Perrin参议员的证人指控Rossum公司，Adelle派Paul与Echo阻止Perrin参议员，却发现Perrin参议员是华盛顿玩偶之家潜伏的玩偶，Perrin的妻子其实是Perrin的监护人。

Paul成功逃脱，Echo被困华盛顿玩偶之家，那里的首席程序员Bennett认识成为Echo前的Caroline。

在Bennett的记忆中Caroline曾丢下重伤的她独自逃命，Bennett为此百般折磨Echo，还对Echo输入了Caroline丢下自己逃命的记忆。Adelle与Topher来到华盛顿玩偶之家要求归还Echo，Bennett却放走了Perrin与Echo，并控制Perrin追杀Echo。

3个月后，Echo与Paul住在一起，人格已经更加完善。Echo帮助了一个因为自己惹上麻箛的西班牙女孩越狱。在洛杉矶，Adelle的地位却陷入危机，玩偶之家被她的上司Harding接管。推测出Rossum公司在计划研发一种能给任何人洗脑的设备的Topher，设计出了图纸。

Adelle为了重新掌管洛杉矶玩偶之家，将图纸交给了Harding。因为Echo受多人记忆共存的影响头痛愈加剧烈，Paul带Echo回到洛杉?玩偶之家接受治疗，Adelle却下令将Echo隔离观察。

Alpha再次归来，这次的目标是杀尽与Echo约会过的所有客户，所有人都认定JoelMynor是下一个目标将他保护起来，然而Alpha的真正目标竟然是Paul。Alpha为了知道Echo会爱上Paul的理由扫描了Paul的大脑，却造成Paul脑死亡，于是将Paul的印记植入给了自己。

Echo与Alpha展开殊死搏斗，Paul通过Alpha的身体向Echo传达杀死自己的请求，下不了手的Echo只能眼看着Alpha再次逃走。玩偶之家?仪器维持着Paul的生命，Echo要Paul为她活下去。

Victor与玩偶之家的合约期满回到了现实生活，然而Rossum公司又使他陷入另一个秘密组织。Boyd隐瞒着Adelle派Echo与Sierra救出了Victor。Adelle却将Echo、Sierra、Victor关进了阁楼。

Echo在Dominic的帮助下找到了Victor与Sierra，探得Rossum公司的秘密，并与Victor、Sierra逃出了阁楼。Topher在Ivy的启发下终于令Paul苏醒。Adelle决定反抗Rossum公司。

为了知道Rossum公司创始人的身份Echo必须取回Caroline的记忆，然而贮存着Caroline印记的存储器却不翼而飞，只剩下过去被Alpha破坏的备份存储器。为了修复Caroline印记，Paul与Victor潜入华盛顿玩偶之家绑架了Bennett。

Adelle下达了封锁玩偶之家的命令，Echo要Victor带着Sierra离开。归来的Claire却成为Rossum公司的潜伏者，为了阻止Caroline的印记被修复杀死了Bennett。Topher?替Bennett的工作修复了存储器，得到Caroline记忆的Echo却发现Rossum公司创始人是Boyd。

Boyd用药物令Echo神志不清，又将众人骗至Rossum总部。察觉到事有蹊跷的Topher在玩偶之家留下了一个备份了自己印记的存储器，令折返的Victor与Sierra发现了Boyd的秘密。另一方面摆脱了药物控制的Echo也向众人揭破了Boyd，然而Topher已在Boyd的欺骗下完成了可以给任何人洗脑的装置。

这是全剧的最终章，本集的故事情节承接第1季。在2020年，Echo和其他幸存者要在人类灭亡前拯救这个已被破坏的世界。